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在线生成3d模型
圣路易斯大学麦克维工程学院的研究人员开发了一种机器学习算法,可以从部分2D图像中创建细胞的连续3D模型,这些图像是在实验室中用相同的标准显微镜工具拍摄的。
他们的发现发表在9月16日的杂志《自然机器智能》上。
电气系统工程和计算机科学与工程助理教授Ulugbek Kamilov说,“我们在数字图像集上训练模型,以获得连续的表示。现在,我可以用任何我想要的方式来展示它。我可以平滑地放大,没有像素化。”
这项工作的关键是使用神经场网络,这是一种特殊的机器学习系统,它学习从空间坐标到相应物理量的映射。经过训练,研究人员可以指向任意坐标,模型可以提供该位置的图像值。
神经网络的一个特殊优势是,它们不需要训练大量的相似数据。相反,只要样本有足够数量的2D图像,网络就可以完全代表样本的内部和外部。
用于训练网络的图像与任何其他显微镜图像相同。本质上,细胞从下面发光;光线穿过它,在另一侧被捕获,形成图像。
卡米洛夫说,“因为我有一些细胞的视图,所以我可以使用这些图像来训练模型。”这是通过将模型信息输入到样本中的一个点来实现的,在该点图像捕捉细胞的一些内部结构。
然后,网络会尽力重建结构。如果输出错误,网络将被调整。如果这是正确的,那么这条道路将得到加强。一旦预测值与实际测量值匹配,网络就可以填充原始2D图像中没有捕捉到的细胞部分。
该模型现在包含细胞的完整和连续表示的信息。3354没有必要保存大量的图像文件,因为它总是可以被神经场网络重新创建。
卡米洛夫说,模型不仅易于存储,而且是细胞的真实表示,在许多方面,它比真实的模型更有用。
“我可以输入任何坐标,生成这个视图,”他说。”或者我可以从不同的角度产生全新的观点.”他可以使用模型将单元格旋转到顶部形状,或者放大以进行更近的观察;用这个模型完成其他数值任务,甚至输入到另一个算法中。